Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的构象研究

李爱秀; 董梅; 张欣

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武警医学 ›› 2005, Vol. 16 ›› Issue (12) : 886-889.

论文

Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的构象研究

李爱秀;董梅;张欣

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Conformational study of PVAP motif in PEVK segment of titin

LI Aixiu;DONG Mei;ZHANG Xin

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摘要

目的通过构象搜索,得到Titin蛋白EVK片段中PVAP基序的低能构象.方法利用分子力学随机构象搜索法和混合MonteCarlo方法,对Titin蛋白PEVK片段中的PVAP基序进行构象搜索.结果随机构象搜索得到的低能构象集中,PVAP的构象骨架分为折叠式和伸展式,其中以折叠式为优势构象;利用混合Monte Carlo方法得到的低能构象与随机构象搜索结果基本一致.结论在拉力作用下,PVAP的构象由折叠式转变成伸展式,使分子在宏观上表现为弹性,为解释其对Titin蛋白弹性的贡献提供了一定的理论依据.

关键词

Titin蛋白 / PEVK片段 / PVAP基序 / 随机构象搜索 / 混合Monte Carlo法

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李爱秀;董梅;张欣. Titin蛋白PEVK片段中PVAP基序的构象研究[J]. 武警医学. 2005, 16(12): 886-889

LI Aixiu;DONG Mei;ZHANG Xin. Conformational study of PVAP motif in PEVK segment of titin[J]. Medical Journal of the Chinese People Armed Police Forces. 2005, 16(12): 886-889